Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SEC31BQ9NQW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SEC31BQ9NQW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SEC31BQ9NQW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SEC31BQ9NQW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SEC31BQ9NQW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SEC31BQ9NQW1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SEC31BQ9NQW1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SEC31BQ9NQW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SEC31BQ9NQW1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms