Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC4Q9NPD3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC4Q9NPD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC4Q9NPD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC4Q9NPD3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC4Q9NPD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC4Q9NPD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC4Q9NPD3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC4Q9NPD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms