Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD248Q9HCU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD248Q9HCU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CD248Q9HCU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms