Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF1Q9HCE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms