Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX8Q9HC52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CBX8Q9HC52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CBX8Q9HC52 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms