Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
LIN28AQ9H9Z2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms