Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf88Q9H8K7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf88Q9H8K7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf88Q9H8K7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms