Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NRDE2Q9H7Z3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NRDE2Q9H7Z3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRDE2Q9H7Z3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRDE2Q9H7Z3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRDE2Q9H7Z3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms