Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1Q9H7V2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1Q9H7V2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms