Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SCAF1Q9H7N4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SCAF1Q9H7N4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAF1Q9H7N4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF1Q9H7N4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms