Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIF1Q9H611 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIF1Q9H611 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIF1Q9H611 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms