Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM12Q9H4Q4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM12Q9H4Q4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms