Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFSD1Q9H3U5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD1Q9H3U5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms