Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC68Q9H2F9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC68Q9H2F9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms