Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-203ENST00000561679 2824 ntTSL 214.78□□□□□ -0.049e-9■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-212ENST00000570009 680 ntTSL 414.4□□□□□ -0.19e-9■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-205ENST00000563831 836 ntTSL 413.72□□□□□ -0.219e-9■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.249e-9■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.259e-9■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)14.75□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 27.33□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.716e-8■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-11■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-207ENST00000430455 184 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.33e-11■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.533e-11■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.533e-11■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.533e-11■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-212ENST00000476557 490 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.443e-11■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 30.7
CSTF2TQ9H0L4 SERF2-211ENST00000430901 483 ntTSL 414.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 30.7
CSTF2TQ9H0L4 SERF2-208ENST00000409617 700 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 30.7
CSTF2TQ9H0L4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 30.7
CSTF2TQ9H0L4 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 30.7
CSTF2TQ9H0L4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 30.7
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 59.5□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 59.35□□□□□ -0.913e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 59.16□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 58.73□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 30.6
CSTF2TQ9H0L4 SEC62-203ENST00000461933 363 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 29.32□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 39.13□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SEC62-209ENST00000487736 508 ntTSL 54.83□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 216.06■□□□□ 0.167e-7■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 414.7□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 414.7□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 513.92□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-214ENST00000492771 564 ntTSL 411.69□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 57.64□□□□□ -1.197e-7■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-209ENST00000474105 663 ntTSL 44.79□□□□□ -1.647e-7■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 CDH2-203ENST00000413878 563 ntTSL 413.11□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 BEAN1-205ENST00000562849 2469 ntTSL 214.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-205ENST00000589183 796 ntTSL 317.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-204ENST00000589168 2125 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-208ENST00000591770 864 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 30.5
CSTF2TQ9H0L4 ATRX-217ENST00000624668 583 ntTSL 514.66□□□□□ -0.069e-9■■■■■ 30.4
CSTF2TQ9H0L4 ATRX-215ENST00000624193 463 ntTSL 414.6□□□□□ -0.079e-9■■■■■ 30.4
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CSTF2TQ9H0L4 ATRX-208ENST00000622960 628 ntTSL 512.36□□□□□ -0.439e-9■■■■■ 30.4
CSTF2TQ9H0L4 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.619e-9■■■■■ 30.4
CSTF2TQ9H0L4 ATRX-213ENST00000624032 3071 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.699e-9■■■■■ 30.4
CSTF2TQ9H0L4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.589e-9■■■■■ 30.4
CSTF2TQ9H0L4 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.589e-9■■■■■ 30.4
CSTF2TQ9H0L4 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)3.46□□□□□ -1.869e-9■■■■■ 30.4
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.269e-8■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 412.46□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 LINC00641-201ENST00000555379 5425 nt8.11□□□□□ -1.117e-9■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 516.95■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 511.43□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.846e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-208ENST00000422409 798 ntTSL 220.3■□□□□ 0.846e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.846e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.086e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.16e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.296e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.336e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 38□□□□□ -1.137e-26■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 47.27□□□□□ -1.257e-26■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 513.28□□□□□ -0.285e-10■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 LINC02320-201ENST00000557778 454 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.765e-9■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 AQR-202ENST00000543879 5722 ntTSL 27.16□□□□□ -1.265e-9■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.385e-9■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 30.3
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.043e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-203ENST00000594844 593 ntTSL 420■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 515.99■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-207ENST00000597547 574 ntTSL 315.76■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 314.31□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 30.2
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