Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNF541Q9H0D2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF541Q9H0D2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNF541Q9H0D2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF541Q9H0D2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF541Q9H0D2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF541Q9H0D2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF541Q9H0D2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF541Q9H0D2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms