Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZMYND12Q9H0C1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZMYND12Q9H0C1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND12Q9H0C1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND12Q9H0C1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms