Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN6Q9BZV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBXN6Q9BZV1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN6Q9BZV1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN6Q9BZV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms