Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SETD2Q9BYW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SETD2Q9BYW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms