Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM55Q9BYV6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM55Q9BYV6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM55Q9BYV6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms