Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP2-1Q9BYU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP2-1Q9BYU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms