Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALN1Q9BXU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALN1Q9BXU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALN1Q9BXU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms