Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms