Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP58Q9BVL2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP58Q9BVL2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms