Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB2BQ9BVA1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms