Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR3CQ9BUI4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3CQ9BUI4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3CQ9BUI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms