Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB6Q9BUF5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB6Q9BUF5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB6Q9BUF5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms