Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC1Q9BTT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC1Q9BTT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms