Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PAGR1Q9BTK6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PAGR1Q9BTK6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PAGR1Q9BTK6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms