Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTKNQ9BST9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTKNQ9BST9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms