Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBGCP2Q9BSJ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms