Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A3Q9BRY0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A3Q9BRY0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A3Q9BRY0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms