Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 BMS1P1-201ENST00000374336 1332 ntBASIC9.78□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 CLPB-211ENST00000542555 421 ntTSL 29.64□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 MICU3-204ENST00000519044 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.6□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 UMPS-208ENST00000495751 558 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-13■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 USP34-208ENST00000467128 531 ntTSL 49.4□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 CHD1-206ENST00000511067 817 ntTSL 58.68□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 CKAP2L-202ENST00000435431 2455 ntTSL 28.57□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 CNOT1-212ENST00000567285 722 ntTSL 48.11□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 FAM160B2-204ENST00000462914 559 ntTSL 38.06□□□□□ -1.123e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 THOC2-210ENST00000455053 573 ntTSL 37.91□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 MICU3-203ENST00000517447 477 ntTSL 57.57□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 PPP1R12B-205ENST00000434615 380 ntTSL 37.5□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 USP34-212ENST00000476716 606 ntTSL 47.11□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 ESCO2-206ENST00000523566 698 ntTSL 36.96□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 PIK3C3-209ENST00000588631 593 ntTSL 46.76□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 USP34-210ENST00000472689 776 ntTSL 56.72□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 VAPA-206ENST00000583475 939 ntTSL 25.88□□□□□ -1.471e-13■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 55.29□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.631e-10■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 CHD1-211ENST00000514344 2955 ntTSL 54.18□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 CKAP2L-206ENST00000497357 551 ntTSL 53.41□□□□□ -1.863e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 MRI1-204ENST00000589290 602 ntTSL 222.35■■□□□ 1.173e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 MRI1-206ENST00000593245 786 ntTSL 321.24■□□□□ 0.993e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 MRI1-203ENST00000588526 862 ntTSL 219.26■□□□□ 0.673e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.519e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.069e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 PDXDC2P-NPIPB14P-204ENST00000530079 2764 ntTSL 514.16□□□□□ -0.149e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.359e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 PDXDC2P-NPIPB14P-203ENST00000529089 1580 ntTSL 212.74□□□□□ -0.379e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 PDXDC2P-205ENST00000534580 566 ntTSL 48.4□□□□□ -1.069e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 PDXDC2P-204ENST00000533264 564 ntTSL 47.2□□□□□ -1.269e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 FBXO7-208ENST00000484607 569 ntTSL 1 (best)6.15□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 35
BUD13Q9BRD0 NOL6-203ENST00000379470 2190 ntTSL 214.09□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 SGSM3-203ENST00000427834 793 ntTSL 221.17■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 SGSM3-207ENST00000469719 1029 ntTSL 517.24■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 SGSM3-202ENST00000417424 666 ntTSL 516.56■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 SGSM3-208ENST00000470518 854 ntTSL 315.83■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 SGSM3-209ENST00000478085 4218 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 PPME1-209ENST00000544401 488 ntTSL 412.17□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 YEATS2-205ENST00000481343 464 ntTSL 411.85□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 34.9
BUD13Q9BRD0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.44e-6■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 ATG101-203ENST00000548915 658 ntTSL 322.63■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 ATG101-204ENST00000550604 671 ntTSL 321.94■■□□□ 1.14e-6■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 ATG101-205ENST00000552544 837 ntTSL 218.93■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 ATG101-207ENST00000553049 846 ntTSL 218.89■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 215.3■□□□□ 0.042e-74■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 PLEKHA7-205ENST00000525581 539 ntTSL 48.12□□□□□ -1.116e-10■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 ALDOA-224ENST00000568435 935 ntTSL 1 (best)19.16■□□□□ 0.664e-31■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 BRD8-223ENST00000511898 586 ntTSL 58.78□□□□□ -14e-8■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 BRD8-221ENST00000489351 553 ntTSL 58.39□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 BRD8-225ENST00000515014 726 ntTSL 55.7□□□□□ -1.53e-8■■■■■ 34.8
BUD13Q9BRD0 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 524.58■■□□□ 1.539e-13■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 ZNF331-219ENST00000513929 1424 ntTSL 220.27■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 34.7
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BUD13Q9BRD0 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.43e-7■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-7■■■■■ 34.7
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BUD13Q9BRD0 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 34.7
BUD13Q9BRD0 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 325.43■■□□□ 1.667e-13■■■■■ 34.6
BUD13Q9BRD0 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 524.39■■□□□ 1.497e-13■■■■■ 34.6
BUD13Q9BRD0 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 514.06□□□□□ -0.163e-10■■■■■ 34.6
BUD13Q9BRD0 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 328.48■■■□□ 2.153e-7■■■■■ 34.6
BUD13Q9BRD0 NECTIN2-204ENST00000587386 452 ntTSL 222.47■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 34.6
BUD13Q9BRD0 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 521.92■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 34.6
BUD13Q9BRD0 MED17-208ENST00000531920 573 ntTSL 36.69□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 34.6
BUD13Q9BRD0 ARHGAP17-215ENST00000575283 2213 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-24■■■■■ 34.4
BUD13Q9BRD0 ARHGAP17-210ENST00000572314 4966 ntTSL 29.5□□□□□ -0.891e-9■■■■■ 34.4
BUD13Q9BRD0 ARHGAP17-204ENST00000570320 2847 ntTSL 27.28□□□□□ -1.241e-24■■■■■ 34.4
BUD13Q9BRD0 CYC1-202ENST00000525122 543 ntTSL 215.39■□□□□ 0.053e-37■■■■■ 34.4
BUD13Q9BRD0 EGLN1-202ENST00000476717 829 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 34.4
BUD13Q9BRD0 REXO1-205ENST00000587524 1390 ntTSL 1 (best)22.96■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 34.2
BUD13Q9BRD0 COL16A1-214ENST00000488128 2854 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 34.2
BUD13Q9BRD0 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.71e-28■■■■■ 34.2
BUD13Q9BRD0 PHF1-205ENST00000428274 836 ntTSL 515.06■□□□□ 06e-15■■■■■ 34.1
BUD13Q9BRD0 PHF1-210ENST00000488767 849 ntTSL 314.52□□□□□ -0.096e-15■■■■■ 34.1
BUD13Q9BRD0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.458e-8■■■■■ 34.1
BUD13Q9BRD0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.38e-8■■■■■ 34.1
BUD13Q9BRD0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.078e-8■■■■■ 34.1
BUD13Q9BRD0 ZNF511-203ENST00000463816 605 ntTSL 518.95■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 34.1
BUD13Q9BRD0 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 224.61■■□□□ 1.534e-13■■■■■ 34
BUD13Q9BRD0 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 229.04■■■□□ 2.244e-25■■■■■ 33.9
BUD13Q9BRD0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.624e-25■■■■■ 33.9
BUD13Q9BRD0 COL16A1-201ENST00000373667 924 ntTSL 521.07■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 33.9
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