Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF559Q9BR84 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF559Q9BR84 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms