Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LPIN3Q9BQK8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPIN3Q9BQK8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LPIN3Q9BQK8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms