Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMCHL2Q9BQD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PMCHL2Q9BQD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms