Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CITED1Q99966 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED1Q99966 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms