Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATF6BQ99941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATF6BQ99941 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF6BQ99941 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF6BQ99941 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF6BQ99941 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF6BQ99941 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF6BQ99941 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF6BQ99941 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF6BQ99941 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms