Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTRCQ99895 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTRCQ99895 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTRCQ99895 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTRCQ99895 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms