Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPA33Q99795 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPA33Q99795 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.1 ms