Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTRQ99707 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MTRQ99707 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTRQ99707 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTRQ99707 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTRQ99707 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTRQ99707 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTRQ99707 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTRQ99707 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTRQ99707 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTRQ99707 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTRQ99707 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTRQ99707 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTRQ99707 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTRQ99707 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTRQ99707 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTRQ99707 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTRQ99707 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTRQ99707 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTRQ99707 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MTRQ99707 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTRQ99707 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MTRQ99707 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTRQ99707 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTRQ99707 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTRQ99707 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTRQ99707 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTRQ99707 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTRQ99707 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTRQ99707 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MTRQ99707 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTRQ99707 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTRQ99707 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTRQ99707 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTRQ99707 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTRQ99707 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTRQ99707 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTRQ99707 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTRQ99707 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTRQ99707 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTRQ99707 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTRQ99707 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTRQ99707 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTRQ99707 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTRQ99707 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTRQ99707 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTRQ99707 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTRQ99707 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTRQ99707 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTRQ99707 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTRQ99707 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTRQ99707 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTRQ99707 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTRQ99707 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTRQ99707 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTRQ99707 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTRQ99707 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTRQ99707 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTRQ99707 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTRQ99707 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTRQ99707 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTRQ99707 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTRQ99707 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTRQ99707 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTRQ99707 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTRQ99707 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTRQ99707 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MTRQ99707 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTRQ99707 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTRQ99707 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTRQ99707 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTRQ99707 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTRQ99707 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTRQ99707 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTRQ99707 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTRQ99707 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTRQ99707 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTRQ99707 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTRQ99707 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTRQ99707 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTRQ99707 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTRQ99707 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MTRQ99707 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTRQ99707 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTRQ99707 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms