Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MEIS3Q99687 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MEIS3Q99687 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MEIS3Q99687 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MEIS3Q99687 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms