Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS8Q99627 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS8Q99627 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPS8Q99627 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms