Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF12Q99081 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF12Q99081 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF12Q99081 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF12Q99081 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF12Q99081 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms