Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNKPQ96T60 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNKPQ96T60 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms