Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX1Q96RV3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX1Q96RV3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX1Q96RV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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