Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF13CQ96RJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms