Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IPQ96QF0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3IPQ96QF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IPQ96QF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms