Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK15Q96Q40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK15Q96Q40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK15Q96Q40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK15Q96Q40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK15Q96Q40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK15Q96Q40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK15Q96Q40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK15Q96Q40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK15Q96Q40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK15Q96Q40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms