Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK3Q96PN8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSSK3Q96PN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms